在一場空前的大地震之後，台灣各地靈異現象劇增。為了因應靈異事件，警方成立「黑日專案」，組織一支以道士為首的專案部隊。高中生道士「陳柏戎」是北區最強隊員，他在一次西門町的除妖行動中，遇上了與媽祖同名的小女孩「林默娘」。於是這兩位都具有兩個靈魂的搭檔，攜手對抗席捲全台的陰謀，展開一連串的現代媽祖冒險譚！